本作的劇本由電影《現代啟示錄》的編劇約翰·米利厄斯（John Milius）撰寫，風格比前幾作更加硬派且具有電影感。遊戲不再是單純的線性關卡，而是採用了較為開放的「沙盒式」戰場設計，並強調了「個人的英雄主義」與「無名士兵的犧牲」之間的對比。
榮譽勳章：歐洲突襲 (European Assault)
序章：老兵的獨白
故事始於現代。一位年邁的老人坐在陰影中，聲音沙啞而低沉。 他是威廉·霍爾特（William Holt）。 二戰期間，他曾是美國戰略情報局（OSS）的精英特工，被派往歐洲戰場最危險的角落執行機密任務。世人稱他為英雄，將勳章掛在他的胸前。 但霍爾特知道真相。 「歷史是由倖存者書寫的。但勝利……勝利是由那些死去的人鑄造的。」 隨著老人的回憶，時光倒流回 1942 年。
第一章：聖納澤爾的突襲（法國）
【1942年3月28日，戰車行動】 霍爾特的第一個任務是支援英國突擊隊執行著名的「戰車行動（Operation Chariot）」。目標是法國聖納澤爾（St. Nazaire）的巨型乾船塢，這是德軍「提爾皮茨號」戰艦在大西洋唯一能進行維修的港口。 霍爾特隨同英軍驅逐艦「坎貝爾敦號」強行衝撞船塢閘門。在劇烈的爆炸與火光中，他跳上岸，孤身一人深入德軍防線。 他的任務是英軍無法顧及的「影子行動」：蒐集德軍名單、破壞燃料庫，並癱瘓防空設施。 他在槍林彈雨中完成了破壞任務，船塢化為火海。 然而，撤離計畫失敗了。接應的船隻被擊沉，霍爾特與倖存的突擊隊員被困在港口小鎮。 面對德軍的包圍網，霍爾特展現了超乎常人的戰鬥力（遊戲中的腎上腺素模式）。他單槍匹馬殺出一條血路，掩護受傷的友軍突圍，最終奇蹟般地逃出生天。
第二章：沙漠之鼠與祕密兵器（北非）
【1942年5月17日，突尼西亞】 OSS 接獲情報，納粹的高級將領**馮·施羅德（Von Schrader）**正在北非沙漠中研發一種足以扭轉戰局的祕密武器。 霍爾特被空投至突尼西亞，與英國第 7 裝甲師「沙漠之鼠」會合。 在烈日灼燒的沙丘上，霍爾特協助英軍對抗德軍的非洲軍團。他摧毀了數輛威力強大的德軍試作型「虎式坦克」，並發現了通往地下基地的入口。 深入地下掩體後，霍爾特發現了德軍正在製造 V2 火箭。 他孤身突入，解救了被俘虜的 SAS（特種空勤團）隊員。在 SAS 的協助下，霍爾特殺入控制室，炸毀了巨大的 V2 火箭，粉碎了馮·施羅德在北非的野心。但施羅德本人卻逃脫了。
第三章：史達林格勒的寒冬（蘇聯）
【1943年1月28日，伏爾加河畔】 追蹤著馮·施羅德的蹤跡，霍爾特來到了二戰最慘烈的絞肉機——史達林格勒。 OSS 雖然與蘇聯結盟，但對史達林並不完全信任。霍爾特的任務不僅是打擊納粹，還要確保某些機密情報不會落入蘇聯手中。 他在斷壁殘垣中與當地的蘇聯遊擊隊並肩作戰。其中有不少是為了保衛家園而拿起槍的女性戰士。 霍爾特摧毀了德軍的列車砲，奪回了被佔領的教堂，並登上了戰略高地——馬馬耶夫崗。 在德軍司令部內，他找到了一份標記為**「病毒之家（Virus House）」**的絕密文件。這是納粹原子彈計畫的代號。 為了防止這份足以毀滅世界的資料落入任何人（包括蘇聯）手中，霍爾特在獲取情報後，毅然炸毀了整個通訊設施，將祕密埋葬在廢墟之下。
第四章：病毒之家的終結（比利時）
【1944年12月16日，阿登森林】 戰爭接近尾聲，希特勒發動了最後的瘋狂反撲——「突出部之役（Battle of the Bulge）」。 OSS 收到消息，馮·施羅德藏身於比利時的阿登森林，並準備使用他在「病毒之家」計畫中製造的終極武器——一枚髒彈（Dirty Bomb）（含有放射性物質的炸彈）。 同時，負責追蹤施羅德的法國抵抗運動女特工**瑪儂（Manon）**失蹤了。 霍爾特被緊急派往戰區。他在冰天雪地中協助受困的美軍第 101 空降師死守防線，抵擋德軍坦克的衝擊。 隨後，他潛入敵後村莊，在一場激烈的巷戰中救出了瑪儂。瑪儂帶來了關鍵情報：施羅德躲在森林深處的一座隱祕工廠裡，炸彈已經組裝完畢。
【最後的決戰】 霍爾特穿越了史上最激烈的阿登戰場，無數美軍與德軍士兵在他身邊倒下。他獨自衝進了施羅德的堡壘。 在工廠的最深處，霍爾特終於面對了宿敵——馮·施羅德。 施羅德啟動了髒彈的倒數計時，狂妄地宣稱這將是第三帝國的勝利。 在封閉的空間內，霍爾特與施羅德及其精銳衛隊展開了殊死決鬥。最終，霍爾特擊斃了施羅德，並在最後一刻解除了髒彈的引信。 巨大的爆炸被阻止了，歐洲免於核輻射的浩劫。
終章：英雄與凡人
【老人的回憶】 畫面回到現代。 威廉·霍爾特看著手中的榮譽勳章，眼神中沒有驕傲，只有無盡的哀傷。 「他們稱我為英雄。但我只是一個士兵。」 他之所以能活下來，是因為有無數像「沙漠之鼠」、蘇聯遊擊隊、美軍空降兵這樣的普通士兵，在他的身邊流血犧牲，為他吸引了火力，為他開闢了道路。 「真正的英雄，是那些沒能回來的人。」 老人緩緩閉上眼睛，彷彿又聽見了那些在戰場上逝去的兄弟們的聲音。
—— Medal of Honor: European Assault (完) ——
【解析】
劇本的深度 本作由約翰·米利厄斯執筆，最大的特色在於淡化了「超級英雄」的色彩。雖然主角霍爾特在遊戲中無所不能（甚至有「腎上腺素」技能），但劇情旁白不斷提醒玩家，這一切的勝利都是建立在無數普通士兵的屍體之上。
戰場的變化 相較於前作的線性射擊，本作引入了更開闊的戰場。玩家可以選擇不同的路徑完成次要目標（如摧毀大砲、獲取文件），這些支線任務會影響最終評價，也增加了戰場的真實感。
神祕的「病毒之家」 遊戲核心圍繞著納粹的核武計畫「病毒之家」展開。這其實是歷史上德國真實存在的原子彈研究代號。遊戲將其演繹為髒彈危機，為二戰背景增添了驚悚的諜報色彩。
