】Prototype：病毒之王與被竊取的名字
序章：停屍間的甦醒
【第 0 天】 曼哈頓的一間停屍間裡，兩名科學家正準備解剖一具屍體。 突然，屍體坐了起來。 **亞歷克斯·默瑟（Alex Mercer）驚恐地看著自己的雙手。他沒有記憶，不知道自己為什麼在這裡，也不知道外面發生了什麼。 當全副武裝的士兵衝進來試圖射殺他時，本能接管了一切。 子彈被他的皮膚彈開，他以超乎常人的速度衝出大樓，跳過了幾十米高的圍牆。 他發現自己不僅擁有怪力，還能將手臂變形成利刃、鞭子，甚至能「吞噬」**他人——吸收對方的身體，獲得其記憶，並能完美偽裝成對方的外貌。 這座城市正在崩潰，一種名為「黑光（Blacklight）」的病毒正在肆虐，將市民變成嗜血的喪屍。而亞歷克斯，似乎是風暴的中心。
第一章：尋找真相與妹妹
【記憶的拼圖】 亞歷克斯透過吞噬相關人員，逐漸拼湊出碎片。他原本是 GENTEK 公司的頂尖研究員，負責黑光病毒的研究。 為了尋找更多線索，他聯繫了妹妹達娜（Dana）。 在達娜的幫助下，他鎖定了一個關鍵人物：伊莉莎白·格林（Elizabeth Greene）。 格林被囚禁在 GENTEK 的大樓裡。亞歷克斯闖入並釋放了她。 然而，這是一個巨大的錯誤。 格林並非受害者，她是病毒的「母親」。她逃脫後，病毒爆發指數級增長，曼哈頓迅速淪為人間地獄。 軍方精銳部隊**「黑色守望（Blackwatch）」接管了城市，指揮官藍道爾將軍（General Randall）**下令不惜一切代價消滅病毒——包括這座城市。
【背叛與進化】 亞歷克斯遭到未婚妻卡倫的背叛，中了黑色守望隊長**克羅斯（Cross）**的陷阱。 他被注入了一種能破壞病毒結構的寄生蟲，失去了部分能力。 在一位前 GENTEK 科學家拉格蘭博士的幫助下，亞歷克斯不僅清除了寄生蟲，還將其轉化為自己的力量，獲得了更強大的裝甲與利刃形態。
第二章：我是誰？
【殘酷的真相】 隨著調查深入，亞歷克斯終於找到了這一連串災難的源頭——他的上司麥克馬倫博士（Dr. McMullen）。 面對憤怒的亞歷克斯，麥克馬倫說出了令人戰慄的真相： 「亞歷克斯·默瑟？他早就死了。」
原來，真正的亞歷克斯在發現公司要肅清研究員時，為了報復，偷走了病毒樣本逃到賓州車站。在被軍隊包圍時，他摔碎了病毒瓶。 真正的亞歷克斯當場被射殺。 病毒在接觸到屍體的瞬間，為了生存，它侵入並複製了亞歷克斯的每一個細胞，獲得了他的外貌和殘存的記憶。 現在的主角，並不是人類亞歷克斯，而是擁有人類記憶的病毒集合體（Prototype）。 這解釋了他為何沒有心跳，為何能吞噬生物。 得知真相的「亞歷克斯」看著麥克馬倫在面前自殺，心中五味雜陳。他是一個怪物，但他依然想保護這座城市，保護達娜。
第三章：至尊獵手與核彈倒數
【最後的合作】 軍方決定對曼哈頓實施核打擊。 這時，神祕的「神祕人」聯繫了亞歷克斯，要求合作阻止藍道爾將軍。這個人竟然是之前的敵人——克羅斯隊長。 兩人潛入航空母艦，殺死了藍道爾。 但就在核彈即將發射之際，克羅斯露出了真面目。 他不是克羅斯。真正的克羅斯早就被伊莉莎白·格林製造的究極生物**「至尊獵手（Supreme Hunter）」**吞噬了。 至尊獵手想要藉助核彈清除所有競爭對手（其他感染者和軍隊），只留下他自己統治廢墟。並且，他要吞噬亞歷克斯，以獲得在核爆中倖存的能力。
終章：原型的救贖
【航母上的決戰】 在裏根號航母的甲板上，兩個頂級掠食者展開了最後的死鬥。 亞歷克斯擊敗了至尊獵手，將其斬首。 但核彈已經進入倒數。還剩幾分鐘。 亞歷克斯駕駛直升機，吊起核彈，飛向大西洋深處。 他在距離城市足夠遠的地方釋放了核彈。 轟——！ 巨大的蘑菇雲升起。直升機和亞歷克斯瞬間被高溫氣化。
【不死之身】 曼哈頓得救了。新聞報導稱危機解除。 在城市的某個角落，一隻烏鴉落在碼頭的殘骸上。 突然，一條紅黑色的觸鬚射出，吞噬了烏鴉。 接著是老鼠、流浪漢…… 無數的血肉匯聚，重新構建出了一個人形。 亞歷克斯·默瑟復活了。只要有一塊細胞殘存，他就能重生。 他站在高樓頂端，俯瞰著這座恢復平靜的城市。 「我尋找真相，卻發現了恐怖。我是所有罪惡的產物，但我也是唯一能終結它的人。」 「我不是人類。我是某種更低等，卻又更高等的存在。」
他拉起兜帽，消失在水泥叢林中。
—— Prototype End ——
【深度解析】
身份認同的逆轉 這款遊戲最震撼的反轉在於主角的本質。玩家一直以為自己在扮演一個受害者復仇的故事，結果發現主角本身就是兇手（病毒）。真正的亞歷克斯是個自私的人渣（為了報復社會釋放病毒），而病毒亞歷克斯反而展現出了更多的人性與責任感。
極致的暴力美學 遊戲將「力量」表現得淋漓盡致。無論是將手臂變成巨鎚砸碎坦克，還是萬千觸鬚終結技（Tendril Barrage），都帶給玩家一種作為食物鏈頂端掠食者的快感。
反英雄的孤獨 結局時亞歷克斯的獨白充滿了悲劇色彩。他拯救了城市，但他永遠無法成為其中的一員。他是一個有意識的瘟疫，註定孤獨地活在陰影中。這為續作《Prototype 2》中他的黑化埋下了伏筆。
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